בעבר תמך האדמו"ר בישיבה. אך משנודעו לו שיטות החינוך הנוהגות בישיבה, יצא חוצץ נגדה.
בביתר עילית קיימת מזה שנים המדרשה החסידית שהקים מנחם בומבך. בומבך, בוגר מכון מנדל שנאסר על ידי גדולי ישראל, מנחיל במכינה שלו ערכים הנחשבים בעיני הציבור החרדי, פסולים.
האדמו"ר שליט"א יוצא במכתב חריף כנגד הישיבה, שבעבר היה לעזר לה בגוף ובממון, ואף שידל אנשים לתרום עבור הישיבה, אך עתה כשהגיעו אליו ידיעות נאמנות על המתחולל בין כותלי המוסד, "ולא האמנתי כי עד כדי כך יטו לחינוך הציוני על כל המשתמע מכך". דברי האדמו"ר.
בעבר, אנשים תממים התפתו ממראהו החרדי של בומבך וצוות המדרשה, ושלחו את בניהם האומללים ללמוד במקום. אך אין ספק, שלאור הזהרתו של האדמו"ר הידוע כאחד מגדולי המחנכים העוסק רבות בשנים בהדרכת בני נוער חרדיים, גם כאלו המתמודדים עם קשיים, בוודאי כולם יחוסו על בניהם ולא ישלחו אותם ללמוד במוסד פסול זה.
לחרדים נודע, כי לאדמו"ר נודע ששליח המוסד בחו"ל משתמש עם המלצה שכתב בעבר למוסד לשם איסוף כספים למען החזקת המוסד. מסיבה זו, וכן כדי להציל את בני הנוער מליפול ברשת מסוכנת זו, פרסם את מכתבו המצורף.